2月14日，人工智能在科研领域的应用取得新突破。西湖大学团队开发的生成式大模型发现一种全新蛋白酶，有望用于治疗阿尔茨海默病。同时，清华大学研发的“超级药物搜索引擎”大幅提升了药物筛选效率，提速达上百万倍。人工智能正加速走进科研核心环节，助力科学研究全面提速，推动更多创新成果涌现。这些进展展示了AI技术在生命科学领域的重要价值与潜力。

2026年2月6日，分子之心宣布其AI蛋白质优化与设计平台MoleculeOS完成重大代际升级。基于创新技术路线，该平台在抗体-抗原复合物及蛋白-小分子复合物结构预测上，精度和性能超越AlphaFold 3等模型。通过NewOrigin（达尔文）算法，解决了AlphaFold 3无法应对的产业难题，可高效模拟蛋白在不同环境下的构象变化和功能响应。相比传统量子化学方法，新平台在保持相同精度的同时，运行效率提升千亿倍，达到工业可用水平。这一突破将为生物医药和材料科学领域带来深远影响。

2月6日，OpenAI在X平台发布消息称，其与Ginkgo Bioworks合作，通过将GPT-5与自动化实验室结合，构建了一个闭环系统，成功将蛋白质生产成本降低40%。这一突破性进展展示了人工智能与生物技术融合的巨大潜力，为未来生物制造领域降低成本、提升效率提供了新方向。

2025年9月，苹果发布基于流匹配技术的蛋白质折叠模型SimpleFold，被网友戏称为“iFold”。该模型以通用Transformer架构为核心，3B参数版本性能追平谷歌AlphaFold2，在CAMEO22基准测试中达其95%，并在CASP14高难度测试集中超越同类模型ESMFold。SimpleFold无需复杂专属设计，推理效率显著提升，搭载M2 Max芯片的MacBook Pro处理512残基序列仅需2-3分钟。研究团队包括*作者王宇阳和通讯作者陆家瑞，均具备深厚学术背景与机器学习研发经验。这一成果展现了苹果在AI领域的跨界创新能力，为蛋白质结构预测提供高效解决方案。

9月24日，苹果研究团队发布轻量级AI模型SimpleFold，用于蛋白质折叠预测。该模型采用流匹配方法，替代传统多序列比对等复杂模块，大幅降低计算成本。相比AlphaFold2和RoseTTAFold等高精度但昂贵的模型，SimpleFold在CAMEO22和CASP14基准测试中表现优异，性能接近前者的95%，且无需依赖昂贵架构。实验显示，其更小的100M版本性能超ESMFold的90%。研究还表明，模型性能随规模和数据增加而提升，尤其在高难度任务中优势明显。苹果希望借此推动高效蛋白质生成模型发展，助力药物研发与新材料探索。

2025年初，OpenAI与生物技术公司Retro Bio合作开发的GPT-4b micro模型在蛋白质工程领域取得突破。该模型成功改进诺贝尔奖获奖蛋白山中伸弥因子的变体，将干细胞重编程标志物表达量提升50倍，并增强DNA损伤修复能力。研究已在多种供体、细胞类型和递送方法中验证，确认衍生iPSC系的多能性与基因组稳定性。GPT-4b micro通过扩展上下文长度与丰富数据训练，在设计不稳定的山中伸弥因子时表现出色，生成序列命中率超30%，显著高于传统方法。此外，优化后的变体在减少DNA损伤方面优于原始蛋白，为再生医学提供新方向。网友对此评价两极，但普遍认为这是AI助力生命科学的重要进展。未来一年或有更多成果发布。

蛋白质基座的GPT时代来了？！ 清华大学智能产业研究院（AIR）周浩副教授课题组与上海人工智能实验室联合发布了AMix-1，首次以系统化方法论构建蛋白质基座模型。这一方法结合了Scaling Law、Emergent Ability、In-Context Learning和Test-time Sca...

2025年7月，诺奖得主David Baker团队在《Science》发表论文，展示通过生成式人工智能设计出高特异性结合pMHC的“人工TCR”，为肿瘤免疫治疗带来突破。团队利用AI蛋白质模型RFdiffusion和ProteinMPNN，在11种肽-MHC靶标上测试，超70%成功激活免疫细胞。其中，针对肿瘤抗原PRAME的设计实现了选择性杀伤癌细胞而不伤害健康细胞。这一方法成本低、效率高，可在实验室前生成数千种潜在粘合剂，适应广泛疾病标志物。论文一作刘炳旭博士表示将成立新公司推动商业化，华盛顿大学已申请临时专利。David Baker此前孵化的23家生物科技公司累计融资超15亿美元，预示着AI正引领抗癌治疗进入高效、低成本、个性化新纪元。

不用抗生素也能抗菌！AI设计新型蛋白质抵御细菌耐药性｜Nature子刊 借助人工智能（AI），研究人员成功设计出一种新型蛋白质，可有效抑制大肠杆菌等抗生素耐药菌的生长。这些蛋白质通过阻断细菌获取铁的能力，为解决全球抗生素耐药性危机提供了新思路。该研究已在《Nature Communication...

AlphaFold斩获诺奖背后：2亿蛋白质结构免费开放，亚太用户破百万 近日，Google DeepMind的产品经理Dhavi Patel在媒体分享会上展示了AlphaFold在蛋白质结构预测及生命科学领域的应用。AlphaFold在全球190多个国家拥有超250万用户，其中亚太地区用户突破1...