谷歌DeepMind团队推出突破性生物模型AlphaGenome,能在1秒内精准定位DNA序列中的变异。该模型能同时预测数千种功能基因组特征,并以单碱基分辨率评估变异效应,在基因表达、剪接、染色质可及性等任务中全面超越现有模型。AlphaGenome是首个统一基因组全任务的单一模型,架构受U-Net启发,通过卷积层和Transformer块处理长序列背景,实现高精度预测。模型输出包括基因表达、剪接模式、染色质状态等11种模态,涵盖5930条人类或1128条小鼠基因组轨道。经过预训练和蒸馏两阶段训练,AlphaGenome在NVIDIA H100 GPU上推理时间小于1秒,效率极高。在24项基因组轨道评估中,AlphaGenome在22项保持领先,预测变异效应方面也有显著提升。AlphaGenome在剪接模态上首次实现全方位预测,为理解疾病机制和发现新治疗靶点提供强大工具。目前AlphaGenome已提供预览版,未来有望扩展至更多物种。
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